1902年，17歲的馬敘倫來(lái)到了上海，經(jīng)常在《新世界學(xué)報(bào)》上發(fā)表文章，使該報(bào)帶上了革命色彩，風(fēng)行一時(shí)。

當(dāng)時(shí)的上海，革命黨人的活動(dòng)頻繁。孫中山的革命思想和活動(dòng)，經(jīng)常通過(guò)革命黨人在日本出版的刊物介紹進(jìn)來(lái)。馬敘倫讀了很多進(jìn)步書(shū)刊，尤其是讀了日本人著的《孫逸仙》一書(shū)，對(duì)他的觸動(dòng)很大。馬敘倫明白，只有走革命的道路，才能推翻清政府。

在后來(lái)的一些事情上，身在廣州的孫中山與處在北京的馬敘倫做到了同聲相應(yīng)。北洋軍閥統(tǒng)治時(shí)期，由于窮兵黷武，內(nèi)戰(zhàn)頻仍，致使政府各部門(mén)經(jīng)費(fèi)支絀，尤以教育經(jīng)費(fèi)更為拮據(jù)。1919年冬，北京大中小60多所公立學(xué)校教職員發(fā)起“索薪”運(yùn)動(dòng)，馬敘倫被北京大學(xué)、北京高師和醫(yī)專(zhuān)公選為教職員會(huì)主席，并擔(dān)任北京小學(xué)以上各高校教職員聯(lián)合會(huì)主席，親赴北洋政府國(guó)務(wù)院交涉。1921年3月，北京高校又發(fā)生“索薪”運(yùn)動(dòng)，馬敘倫依然是領(lǐng)導(dǎo)者。同年6月3日，馬敘倫等人赴徐世昌的總統(tǒng)府第三次“索薪”時(shí)，還遭總統(tǒng)府馬隊(duì)襲擊，馬敘倫頭部受重傷。馬敘倫在《馬敘倫自述》中寫(xiě)道：“六三事件的規(guī)模，不下于五四運(yùn)動(dòng)，它是有革命意義的運(yùn)動(dòng)……孫中山先生在廣州也給我們正式的援助，北京的軍閥政府的威信就此一落千丈?！?/p>

1924年年底，孫中山為了與段祺瑞商談?wù)匍_(kāi)國(guó)民會(huì)議，“以謀中國(guó)之統(tǒng)一與建設(shè)”，扶病至京。馬敘倫對(duì)孫中山此行抱有極大希望，于是前往車(chē)站迎接。路上，見(jiàn)青年學(xué)生絡(luò)繹不絕涌向車(chē)站，市民也擠向正陽(yáng)門(mén)前迎候。民心所向，讓馬敘倫大為感動(dòng)。

第二年，孫中山不幸逝世，馬敘倫悲痛萬(wàn)分，賦七律一首以悼念：

先生畢竟是人豪，天下為公字字敲。

思想每隨時(shí)代進(jìn)，堅(jiān)貞不為大風(fēng)撓。

奔走卌年余薄產(chǎn)，纏綿一病返天曹。

使公今日猶操?lài)?guó)，郭李勛名未足高。